Mit dem Modul Webservice (WSR) können Informationen mit anderen oder innerhalb desselben Systems ausgetauscht werden. Alle Daten können dabei plattformunabhängig exportiert oder importiert werden.
Durch die flexible Struktur von TROIA können alle Module auch mit dem Webservice ausgeführt werden. Dadurch kann eine vollständig integrierte Umgebung geschaffen werden, die die Verwaltung aller Daten sowohl innerhalb des Systems als auch mit anderen Systemen ermöglicht. Zum Beispiel können hier Transaktionen wie die Erfassung von Rechnungen in der Buchhaltung, die Übertragung von Aufträgen ins System, der Export von Produktionsaufträgen und die Erstellung von Materialdatensätzen durchgeführt werden. Es können Webservice-Definitionen vorgenommen werden und benutzerbasierte Berechtigungen, die für einen bestimmten Zeitraum gültig sind, festgelegt werden.